Chuck小组被通缉，Beckman将军表面上痛斥他们是叛徒，实际上却通过摩斯密码暗示他们快逃，前无退路，后有追兵，还不能连累家人，Chuck、Sarah和Casey的处境堪舆，Chuck、Sarah逃到父亲“猎户座”的安全屋，Casey则去会面将军，试图找出谁要把Chuck小组赶尽杀绝。另一方面Eille夫妇策划着一场有惊喜的小约会，Eille用Chuck的账户在网上订了晚餐，却被CIA的特工误认为是Chuck和Sarah抓住了，为了救家人，Chuck被迫交出了Omen，世界上最危险的病毒终于释放了……