Beckman将军告诉Chuck，在背后操纵Decker的黑手终于找到了，居然是Shaw！与此同时，Shaw利用Omen病毒打开了监狱的牢门，越狱后还绑架了Sarah，他要挟Chuck去CIA的基地偷“澳门设备”，Chuck终于搞明白了Shaw的阴谋：他想制造出互联系统的3.0版安装进自己的大脑，这样就所向无敌可以重新获得CIA的重用了。Shaw伪装成Sarah的声音骗Chunck前去地堡，他要杀了Sarah为妻子报仇，除去心头大患Chuck，但他万万没有想到，Chuck先他一步替祼了“澳门设备”里的内容，Shaw非但没有装载上互联系统3.0，反倒把之前的互联系统卸载掉了……